申請は、オンライン申請、郵送又は持参による方法で申請が可能ですが、ドローン情報基盤システム（DIPS）のサイトからオンライン申請を行う方法をおすすめしています。

オンライン申請のメリットとしては、初めてでも申請書作成がそれ程難しくないこと、以前に許可・承認を受けた申請書を再利用し申請書作成ができるため最初から作成するよりも手間をかけずに申請書作成が可能であること、原則24 時間 365 日（ただし、送信された申請内容の審査開始は、各担当機関の窓口時間のみとなっているため、祝祭日や年末年始を除く月曜日から金曜日になります。また、ご利用可能時間内でも、サービスの運用停止、休止、中断等が行われることもありますので、申請は十分に余裕をもって行うことが大切です。）いつでも申請書の提出ができること等が挙げられます。

許可等の期間は、人又は家屋の密集している地域の上空で夜間における目視外飛行、催し場所の上空における飛行を除き、原則として3か月以内となりますが、申請内容に変更がなく継続的に無人航空機を飛行させることが明らかな場合には、１年を限度として許可等が行われます。